2201年の日本。国有の子どもの一人として政府に養われている十二歳の少女、棗は誰かに呼ばれているような気配を探ろうと施設を飛び出してしまう。その先で思いもよらない大きな流れに巻き込まれ──。
裏ビデオ撮影のために機械に改造されてしまった幼い少女「アオ」と、自ら望んで非人間型ロボットに改造され、自分の電脳を破壊する「エクセル」。 所有者のジャックの視点から見る、人間でもロボットでもない少女たちのお話をグロテスクに描きます。
「透明妖の方が安全だ。」ゲラは言った。へびとかげおじさんは、「変装じゃ。」と言い、温泉に、地底人「ワニ」探しをする。